NVIDIA Clara Parabricks

端到端基因组测序分析

从 DNA 到 RNA,NVIDIA Clara™ Parabricks 能显著加快基因组数据的初级、二级和三级分析速度。为此,它使用了专为位于本地或云中的高吞吐量实验室设计的成套软件,以及能让开发者构建强大基因组学计算工具的技术栈。

加快基因组分析速度

  • 面向高吞吐量实验室
  • 面向开发者
Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines

NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 基于博德研究所的基因组分析工具包 (GATK),是一款 GPU 加速的即用型软件套件,适用于群体基因组学的 DNA 种系变体识别、癌症基因组学的 DNA 体细胞变体识别以及从全转录组到单细胞分析的 RNA 测序项目。

Clara Parabricks Pipelines 在速度、准确性和可扩展性方面进行了优化,能够运行 GATK4.1 最佳实践,而且完全可配置,允许用户选择要运行的步骤、参数设置和管道版本。

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出色的二级分析性能和吞吐量

Clara Parabricks Pipelines 基于 NVIDIA A100 Tensor Core GPU 运行,可提供强大的性能,能将 DNA 种系变体识别的分析时间缩短到 20 分钟。GPU 加速还能让用户显著降低云计算成本(与仅使用 CPU 的解决方案相比,最高可降低 50%),从而从中受益。

GPU vs. CPU-Only Performance

为何使用 Clara Parabricks Pipelines

易于上手

Clara Parabricks Pipelines 可在 10 分钟内设置完毕。观看这个逐步讲解的教学视频,开始体验 DNA 和 RNA 测序项目的高吞吐量分析。

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更快速的诊断,更好的治疗效果。

Clara Parabricks Pipelines 返回结果的速度比非 GPU 加速的解决方案快。了解 TGEN 如何使用当天的结果研究健康细胞和病变细胞的全基因组序列,以更好地为每个患者定制有效的疗法。

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更好地了解基因组

通过在云中或本地运行,Clara Parabricks Pipelines 可以帮助研究人员更快、更好地了解病毒性传染病(如 COVID-19)– 从病毒的演变到人体的反应,再到人体的易感性。观看视频以了解详情。

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Clara Parabricks Pipelines 采用者

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population-genome-program
thailand-population-genome-program
personalis
tgen
institute-of-medical-science-university-of-tokyo
national-taiwan-university-hospital

免费试用一个月

Clara Parabricks 工具包

Clara Parabricks 工具包

NVIDIA Clara Parabricks 工具包内含多个 GPU 加速的边缘库、参考应用程序和开源应用程序,专供开发人员构建用于基因组分析的 AI 辅助工作流程。借助该工具包,他们可以优化从头测序基因组组装的对应、对齐和打磨工作,并提高单细胞表观基因组学的分辨率。

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新闻

新的功能,更快的速度。

借助 NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 3.0 这个新版本,用户可以获得提升 30% 的性能,访问新的 RNA 分析管道,并在 DNAnexus 平台上启动云中的软件套件。

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Artemis 超级计算机克服群体基因组学和 COVID-19 挑战

借助 NVIDIA DGX™ 和 NVIDIA Clara Parabricks,Artemis 超级计算机正努力更好地了解阿布扎比市民的基因组以及改善该国的医疗健康状况。

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