Tesla

GPU 应用

分子动力学

分子动力学应用特别适合NVIDIA®(英伟达™)的大规模并行架构。在下面的图表中,我们着重说明了在VMD方面所做的工作,以及NAMD和HOOMD等分子动力学软件包。

Molecular Dyanamics

AMBER 与 NAMD 速度提升 5 倍

令 AMBER 与 NAMD 的速度提升 5 倍。
立即免费试用 GPU。 >
Molecular Dynamics Ion Placement VMD

AMBER中的广义伯恩模拟计算
圣迭戈超级计算中心

Molecular Dynamics Lennard Jones

GPU集群中的NAMD升级
伊利诺伊大学厄本那香槟分校,理论与计算生物物理学研究组

下载CUDA分子动力学软件
> HOOMD: 高度优化的面向对象分子动力学
> LAMMPS GPU端口
> GPUGrid.net
> 用于在GPU(图形处理器)上加速分子动力学的OpenMM库
> ACEMD生物分子动力学工具包
> BigDFT : DFT (Density functional theory密度泛函理论)电子结构编码 - PDF文档
> TeraChem:首款针对CUDA GPU而作的量子化学代码


 
CUDA分子动力学技术报告
> 加速VASP:利用图形处理器 (GPU) 加速平面波电子结构运算
> NAMD以及VMD出版物
> 基于GPU 硬件的流畅Particle-Mesh Ewald (PME) 方法执行
> 在GPU(图形处理器)上加速AMBER分子动力学模拟
> HOOMD
> 荧光显微术
> 为分子动力学模拟收获图形动力
> Folding @ home (运行 GROMACS)
> Todd Martinez work on Quantum Chemistry on GPUs
> Q-Chem on CUDA

相关纵向领域的CUDA加速
> 计算化学
> 医学成像
> 生物信息学以及生命科学
> 针对 C、C++、FORTRAN 的 ArrayFire GPU 函数库
> MATLAB加速
 
又见
> Tesla/CUDA成功案例
> 其它Tesla纵向解决方案
> CUDA 软件开发工具和数据库
> Buy Tesla