NVIDIA® Parabricks® 是一个可扩展的基因组学分析软件套件,能够充分利用全栈加速计算在几分钟内处理数据。它与所有领先的测序仪器兼容,支持多种生物信息学工作流程,并集成了 AI,有助于实现超高的准确性,并允许用户随心定制。Parabricks 是一种经济高效且节省空间的解决方案,非常适合用于侧重推进疾病理解和管理的大型基因组学项目。
将生殖细胞系分析优化缩短至 10 分钟,这是 BWA-MEM 和 GATK在市场上的最快应用。
与仅使用CPU的解决方案相比,速度提升高达 100 倍,计算成本降低高达 50%。
通过使用工作流描述语言 (WDL) 和 NextFlow 配置加速工具来创建功能强大的自定义工作流。
借助 DeepVariant 训练框架微调 DeepVariant,以实现更准确的变异识别。
Parabricks 以公共容器的形式在 NVIDIA NGC™ 上提供,可在本地、任何云服务平台或任何服务提供商环境中使用。为了满足客户需求,让他们能够在临床工作流、大型测序项目、高吞吐量平台或其他需要即时协助的工作流程中获得 Parabricks 的技术支持,NVIDIA 提供了 NVIDIA AI Enterprise。
比较 Parabricks 与 NVIDIA AI Enterprise 的优势
通过 Parabricks 微服务,用户可以轻松访问有助于加速基因组学分析的应用。为了在任意位置部署以及自行托管 AI 应用和数据,NVIDIA NIM 和 CUDA-X™ 微服务提供了速度超快、性能超高的生产级 AI,其中前者有助于加速推理模型的运行速度,后者适用于 NVIDIA 加速 SDK 和工具。
Parabricks 由 NVIDIA DGX™ Cloud 提供支持。NVIDIA DGX™ Cloud 是面向开发者的端到端 AI 平台,基于最新 NVIDIA 架构构建,并与全球领先的云服务提供商合作,提供灵活可扩展的功能。
通过有关 NVIDIA Parabricks 的免费实战试验室,畅享 NVIDIA AI Enterprise 解决方案。
访问 Parabricks 的相关文档、教程和社区支持。
NVIDIA Parabricks 是用于二级基因组分析的 GPU 加速软件套件。 Parabricks 与所有主流的测序仪器兼容,支持多种生物信息学工作流程。
Parabricks 可加快二级基因组分析的速度、降低成本并提高准确性。
是的,Parabricks 与开源工具的结果相符,因此您可以切换开源工具并获得与 Parabricks 完全相同的结果。 4.3.1 版本的最新基准测试结果在下表中列示。
运行时间,以分钟为单位。 使用 Illumina 数据,对 FQ2BAM、BWA-Meth、DeepVariant 和 Haplotype Caller 进行 30 倍全基因组测序。 使用 Illumina 数据对 Mutect2 进行 50 倍的肿瘤和正常全基因组测序分析。
Parabricks 可作为 NVIDIA NGC™ 上的公共容器在本地或任何云服务平台或提供商上使用。
为了满足客户需求,让他们能够在临床工作流、大型测序项目、高吞吐量平台或其他需要即时协助的工作流程中获得 Parabricks 的技术支持,NVIDIA 提供了 NVIDIA AI Enterprise。
Parabricks 可以在公有云提供商、平台和合作伙伴上运行,也可以在本地部署。
硬件需求
软件需求
Parabricks 受大多数 NVIDIA 企业级 GPU 支持,包括 A100、A6000、A40、A30、A10、L40、T4 和 V100 Tensor Core GPU。
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