- 分子动力学
分子动力学应用特别适合NVIDIA®（英伟达™）的大规模并行架构。在下面的图表中，我们着重说明了在VMD方面所做的工作，以及NAMD和HOOMD等分子动力学软件包。
凭借NVIDIA®（英伟达™）Tesla™ Bio Workbench，生物物理学家和计算科学家们实现了生物化学研究的突破性发展，科学工作流得以优化，研究进程得以大幅推进。了解详情。
 |
 |
| 视觉分子动力学中的离子排列 Stone, Phillips, Hardy, Schulten |
在一颗NVIDIA GPU上处理HOOMD 运行LAMMP时战胜了16个CPU核心 Anderson, Lorenz, Travesset |
下载CUDA分子动力学软件
- 了解VMD中的GPU加速
- NAMD 2.7 Beta 2 包含CUDA加速
- HOOMD: 高度优化的面向对象分子动力学
- LAMMPS GPU端口
- MDGPU
- GPUGrid.net
- 用于在GPU（图形处理器）上加速分子动力学的OpenMM库
- 利用OpenMM的GROMACS
- ACEMD生物分子动力学工具包
- AMBER (即将问世) – see paper using OpenMM
- BigDFT : DFT (Density functional theory密度泛函理论)电子结构编码 - PDF文档
- TeraChem：首款针对CUDA GPU而作的量子化学代码
- 2008年超级计算大会上为NAMD 和 VMD 推出的CUDA指南。
- NAMD以及VMD出版物
- 基于GPU 硬件的流畅Particle-Mesh Ewald (PME) 方法执行
- 在GPU（图形处理器）上加速AMBER分子动力学模拟
- HOOMD
- 荧光显微术
- 为分子动力学模拟收获图形动力
- Folding @ home (运行 GROMACS)
- 分子动力学
