GPU-HMMER on Tesla GPUs
GPU-HMMER是一款生物信息学软件，通过利用NVIDIA®（英伟达™）Tesla GPU的大规模并行CUDA架构，该软件能够使用隐马尔科夫模型配置文件进行蛋白质序列比对。其速度可达HMMER （2.0）的60至100倍。
下载与安装
基准测试数据
GPU-HMMER利用GPU来为隐马尔科夫模型检索工具加速，可实现60至100倍的速度提升。GPU-HMMER使用工作站的多颗Tesla GPU取代CPU之后，计算时间从几小时大幅缩减至几分钟。
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论文与演示文稿
- J. P. Walters, V. Balu, S. Kompalli, et al. 肝脏影像分割与HMMER数据库检索中的GPU应用评估[C]. 2009国际并行与分布式处理研讨会（IPDPS）.
- 更多关于利用GPU加速生物信息学应用程序的出版物。
论坛
GPU解决方案
基于GPU的台式个人超级计算机或数据中心解决方案中可以部署 Tesla Bio Workbench软件。这些解决方案基于革命性的大规模并行CUDA架构，可加速计算科学的发展步伐。
推荐硬件配置
| 台式机工作站配置 | 数据中心配置 |
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