AMBER on Tesla GPUs
AMBER 中的显性溶剂粒子网格埃瓦尔德 (PME) 分子动力学以及隐性溶剂广义波恩(GB) 模拟均已使用英伟达™ (NVIDIA®) CUDA™ GPU 来加速。 只要将 AMBER 与一款基于英伟达™ CUDA™ 架构的英伟达™ Tesla™ GPU 计算解决方案搭配使用，用户就能够在一颗四核 CPU 的基础上实现 10 倍以上的速度提升。
下载与安装
- 下载AMBER 11（可支持CUDA GPU）
- 隐溶剂广义伯恩（Implicit solvent Generalized Born）模拟
- NVE、NVT和 NPT正则系综中的显溶剂PME（Explicit solvent PME）模拟
- 下载页面同时提供安装指南
基准测试数据
AMBER 11 NVIDIA®（英伟达™）benchmark页面。图像由圣迭戈超级计算中心提供。
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论文与演示文稿
- 基于 AMBER 11 GPU 加速的全新出版物即将推出
- 全新旗舰英伟达™ Tesla™ M2090 GPU 在 AMBER 分子动力学模拟上开创纪录
- 来自 2010 年 GPU 技术大会，“针对 GPU 以及 GPU 集群而重新设计分子动力学软件 —— Scott Le Grand，英伟达
- 来自 2010 年 GPU 技术大会，“将 GPU 应用于主流分子动力学软件包” – Ross Walker，圣地亚哥超级计算中心
- 来自 2009 年超级计算大会：AMBER 支持英伟达™ CUDA™ 技术的概述 —— 吸取经验，增长才干 —— Ross Walker，圣地亚哥超级计算中心, 来自 2009 年 GPU 技术大会
- 来自 2009 年 GPU 技术大会：在 GPU 上计算生物物理学以及远距离静电学 —— Scott Le Grand，英伟达
- 有关利用 GPU 加速分子动力学应用程序的更多出版物
- 有关利用 GPU 加速量子化学应用程序的更多出版物
论坛
采访 / 视频
- 2010 年 GPU 技术大会，英伟达首席执行官黄仁勋的主题演讲视频
- NVIDIA®（英伟达™）nTersect SC09博客: AAMBER研究性代码凭借NVIDIA CUDA实现了惊人的性能提升
GPU解决方案
基于GPU的台式个人超级计算机或数据中心解决方案中可以部署 Tesla Bio Workbench软件。这些解决方案基于革命性的大规模并行CUDA架构，可加速计算科学的发展步伐。
推荐硬件配置
| 台式机工作站配置 | 数据中心配置 |
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