VMD on Tesla GPUs
VMD是利用3D图形和内置脚本对大型生物分子系统进行显示、动画处理和分析的分子可视化程序。VMD中多个关键内核与应用程序目前均能够利用NVIDIA®（英伟达™）GPU（图形处理器）的大规模并行CUDA架构。正如下文所示，与单纯在CPU上运行时相比，当使用NVIDIA®（英伟达™）CUDA GPU时，这些应用程序实现了20至100倍的速度提升。
下载与安装
- 下载VMD 1.8.7 二进制文件 (美国伊利诺伊大学香槟分校网站)
- 发布说明
基准测试数据
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| 数据来源：美国伊利诺伊大学厄本那香槟分校理论与计算生物物理学研究组 |
这些成绩摘自NVIDIA®（英伟达™）VMD benchmark页面，是使用GPU运行VMD具体的 benchmark分数。
演示文稿
- 克劳斯•斯图尔登（Klaus Schluten）团队关于VMD和NAMD上GPU加速的著作与演示
- 来自SC09: 利用GPU计算加速分子模型应用 - John Stone，美国伊利诺伊大学厄本那香槟分校贝克曼高级科技研究院
- 来自2009年 GPU技术大会: VMD中的GPU加速可视化与分析 - John Stone，美国伊利诺伊大学厄本那香槟分校贝克曼高级科技研究院
- 更多关于使用GPU加速分子动力学应用软件的著作
采访 / 视频
- SC09来源: 美国伊利诺大学的John Stone谈论使用GPU更快地运行VMD 412X
- NVIDIA®（英伟达™）nTersect SC09博客: S利用NVIDIA®（英伟达™）GPU（图形处理器）研究H1N1 病毒
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GPU解决方案
基于GPU的台式个人超级计算机或数据中心解决方案中可以部署 Tesla Bio Workbench软件。这些解决方案基于革命性的大规模并行CUDA架构，可加速计算科学的发展步伐。
推荐硬件配置
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