MUMmerGPU on Tesla GPUs
MUMmerGPU是利用GPU进行高通量序列比对的生物信息学软件。通过利用NVIDIA®（英伟达™）Tesla GPU大规模并行CUDA架构，它能够加速多个查询序列与单个参考序列之间的比对工作。
下载与安装
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- 软件下载页面还包含了安装说明
基准测试数据
与在CPU上运行MUMmer 时相比，MUMmerGPU（2.0版本）可实现3至4倍的速度提升。下图中的数据均基于MUMmerGPU 1.0版本，很快即将更新这些数据。
 数据来源：美国马里兰大学 |
论文与演示文稿
- M. Schatz 等. 利用图形处理器执行高通量序列比对[J]. 2007 BMC生物信息学.
- C. Trapnell, M. Schatz. 为DNA序列比对而优化数据密集型GPGPU计算[J].并行计算杂志. 2009-8.
- 更多关于利用GPU加速生物信息学应用程序的出版物。
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GPU解决方案
基于GPU的台式个人超级计算机或数据中心解决方案中可以部署 Tesla Bio Workbench软件。这些解决方案基于革命性的大规模并行CUDA架构，可加速计算科学的发展步伐。
推荐硬件配置
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