CUDA-BLASTP利用NVIDIA®(英伟达™)Tesla GPU大规模并行CUDA架构,可提升NCBI BLAST的蛋白质序列数据库扫描速度。CUDA-BLASTP还具有一个实用程序,可以将FASTA格式数据库转换为可由CUDA-BLASTP读取的文件。
下载与安装
基准测试数据
与在Intel i7-920 CPU上运行NCBI BLAST (2.2.22)时相比,在搭载两颗Tesla C1060 GPU的工作站上运行CUDA-BLASTP可实现10倍的速度提升。GPU取代CPU之后,计算时间从几分钟大幅缩减至几秒钟。
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论文与演示文稿
论坛
基于GPU的台式个人超级计算机或数据中心解决方案中可以部署 Tesla Bio Workbench软件。这些解决方案基于革命性的大规模并行CUDA架构,可加速计算科学的发展步伐。
推荐硬件配置
| 台式机工作站配置 | 数据中心配置 |
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