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| 晶体化的 M. 肺结核蛋白质 | 蛋白质是由人体正常运行所需的氨基酸组成。分析蛋白质的3D结构可以让人们深入了解其生理机能、加快有效药物和制剂的开发。了解蛋白质结构主要是通过晶体学方法。在晶体学中,蛋白质被强制分成晶体,这需要成千上万次的试验才能实现。传统上,每次试验都是由人眼观察来检测蛋白质晶体。

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| 显微镜下的蛋白质晶体结构 | 为使这一流程自动化,研究人员正在使用视像处理技术。Axygen Biosciences开发出了一种先进的成像算法,该算法在四百万像素的图像上利用多个“快速傅利叶变换”(Fast Fourier Transforms,FFT)、交叉相关及其它非线性过滤。过去,由于处理器速度的限制以及专用系统的成本很高,一直很难实现这一算法。为解决这些问题,Axygen Biosciences改用NVIDIA将处理时间减小了10 个系数。强大的NVIDIA SLI™技术(双核心和四核心)提供了额外的1.7 到3.5倍的加速,从而实现了几乎实时的计算。

Axygen Bioscience的Dominique Toppani评论道:“我们的NVIDIA平台正在消除蛋白质晶体成像的传统障碍。我们相信NVIDIA在图形与用户友好开发工具结合领域的不断创新将会使处理速度更快,而且不要求我们更改一行代码。强大的解决方案将帮助实验室以更有效和自动化的方式找到蛋白质晶体,最终使目标药物的制造更快,从而提高生命质量和拯救生命。
有关详情,请访问: http://www.axygenbio.com
Brent Segelke图像库,Lawrence Livermore National Laboratory。 |